卫军更为精锐的称之为侍卫军，即卢俊义自己亲<军卫陆军第一军，这是精锐中的精锐，骑兵、
兵、弩兵≮兵、侦察兵、特种兵、信鸽兵、滑翔兵、辎重兵、工兵、海军陆战团、水军陆战团、娘子团、童子团、道士团一应俱全。虽然编制齐全，但非直接战斗人员的比例还是比较少，而且这些人员的加入反倒增加了整体的战斗力。所以卢俊义并没有刻意地提高近卫军的兵力，依然是五万，卢俊义亲自掌控的近卫师也只是一万，但这一万精锐足以抵挡其他一个军。武松统领的侍卫团二千精锐昼夜不停地护卫元首。陆军八个军指挥系统如下：陆军都督卢俊义，副都督朱武、关胜，每五年调整一次中高层将领，但基层训练不变。
第一军军长卢俊义，参军朱武，五个师长分别为卢俊义、林冲、方杰、岳飞、乔郓，武松、李逵、扈三娘、花香护驾，李师师、钱燕儿做元首秘书随军；杨再兴。皋、罗延庆、严奇、伍尚志、余化龙、何元庆、吉青、汤怀、张显诸少壮派接替擢升而出的前辈而就近卫军的团长、副师长等职务；王佐、诸葛英々全则随军参谋同时跟着卢俊义和朱武学习兵法。
第二军军长关胜，参军公孙胜，五个师长为关胜》文恭∮万
、索超、)泰；第三军军长王进，参军包道乙，五个师长为王进、栾廷玉、司行方、秦明·；
第四军军长王寅，参军李助，五个师长为王寅、朱、晁盖、袁朗、董平；
第五军军长呼延灼，参军郑彪，五个师长为呼延灼、张清’宝、思文、杜微；
第六军军长方百花，参军李助，五个师长为方百花、杨志、宣赞、魏定国、单廷；
第七军军长杜_，参军樊瑞，五个师长为杜_、徐宁》鹏、厉天润、贝应夔；
第八军军长姚平仲。参军高玉。五个师师长姚平仲、花荣》进、韩世忠、李襄；
其中吕方、郭盛、解珍、解宝、刘唐、项充、李衮、龚旺、丁得孙、韩滔№’勇、黄爱、晁中、陈达、雷横、鲍旭、厉天佑、吴值、薛斗南、徐白、张韬、夏侯成、雷炯、计稷∩胜、滕、滕、寇、谢宁分散在各个陆战师做副师长或团长。
海军三个军地指挥系统如下：海军都督李俊。副都督孙立、卢俊海。也是每五年调整一次中高层军官。
第一军军长李俊。五个师长为李俊、阮小七、童威、杨
、耿明初；第二军军长孙立。五个师长为孙立、阮小五、张横、华普方、耿明达；
第三军军长卢俊海，五个师长为卢俊海、杨虎、孙新、顾大嫂、童猛；
海军各级参军为当初俊义武馆和后来梁山军校中学员为主，更主要的是卢氏子弟。
水军三个军的指挥系统如下：水军都督张顺，副都督刘梦龙、阮小二、；这也是每五年调整一次中高层军官。
第一军军长张顺，五个师长为张顺、邓飞、邹渊、谢福、胡俊；
第二军军长刘梦龙，五个师长为刘梦龙、杨林、卜青、狄成、翟源；
第三军军长阮小二，五个师长为阮小二、邹润、成贵、乔正、胡显；
水军创立较晚，各级参军以梁山军校学员为主。
陆军、水军、海军各军的第二个师长是军长的顺位接班人，即军长出现什么意外或调任后，便由第二师师长接任，虽然好几个军长是根据山头来安排的，但第二师师长的任命安排都是卢俊义地亲信，第二师师长同时兼任该军的第一副军长。
镑级参军分成两种，一种是跟宗教事务总署有关系的，称之为道术参军，一种跟
派事务总署有关系，称之为政治参军，政治参军换句话便是后世的政委，在参军中占多数，政治参军平时在军中
收复兴员、组织章学习、政治宣传、做思想工作，等占领一个新领地他们就要开始忙碌安民告示、政治宣传、做军政编制、做轻度土改等一系列安定地方并将地方整顿在齐国治下的活动，然后在该地收复兴员；而道术参军顾名思义就像公孙胜那样用道术支援军事行动地玄教高手，平时在军中收玄教信徒、组织教义学习、组织简单健身道术修炼、用道术鼓舞士气，到战时用道术帮助军队获胜，到地方则协助政治参军搞好宣传活动同时还要地方发展玄教信徒。信玄教和信复兴
并不矛盾，一个是宗教信仰，一个是仰，两者都信那是最好，四五年内，齐国
卫军将士同时加入复兴和玄教，那些没有全部或全部没有加入的都是新兵，他们是参军们要争取的。警卫军编制内也有这样的参军队伍，他们执行着如同卫军一样的任务，不同的是战争和发展新土地地任务几乎没有，但他们要时刻准备着会因为优秀而被擢升到卫军。这些参军的本质工作是参谋，这一点自然要保证住，他们除了趁休战时期去上梁山军校学习军事技术之外，在战争时期也是每隔一段时间组织学习，这是卢俊义长抓懈的一件事情，在将领中亦是如此。在政务院和地方政务上，鲁东道、鲁西道、淮东道、淮西道、江汉道、江苏道、浙东道、浙西道、汉南道、汉北道、东海道、中海道、北海道、台湾道，总共十四个道，八十个州。有张叔夜、侯蒙、李纲、赵鼎、曾孝蕴、蒋园等赵宋旧臣和卢俊信、萧让、薛嵩、傅奇、吴正科等卢齐新臣一起担当政务院和下属道、州、县、镇的行政，其中赵宋旧臣可以为正而卢齐新臣为辅，但主要实权还是卢齐新臣所掌握，赵宋旧臣只是第一代的过渡。
在军务院和地方军务上，因为某县城可能是州治所，也可能是道治所，所以一般镇寨和普通县城驻扎地是警卫军，各州治所城池里根据战略重要
决定驻扎少量卫军协防，各道治所和各道战略要地都酌量驻扎部分卫军。各道、州、县、镇的警卫军是层层向上负责，各道警卫军长官称为兵马都统制，但只能指挥调动警卫军，只有临时战争时期授予的节度使才能同时指挥所有辖区内的军权，但节度使无权动用财权，否则视同谋反。许贯忠执掌军务院，可以在元首卢俊义指令下调动所有兵马，而宗泽、扈成负责管辖所有警卫军，所有卫军有卢俊义、朱武管辖，以宗泽、陆登、张所、徐京、王文德、王焕、张开、项元镇、韩存保等赵宋旧将和扈成、卢俊勇、邢钢、黄光明、任
等卢齐新将一起执掌警卫军，显然这些赵宋旧将也只是过渡。卢俊义目前的卢齐政府还是军政优于民政的军政府，一切以军事行动为中心。
马政就是很明显的军政府风格。卢俊义为了
后对抗契丹、项‘真、蒙古等北方游牧民族地骑兵，决心从一开始就大力发展马政建设，以备军用。一个轻骑兵所花费的可以养三到五名轻步兵，也就是说建立一支十万
骑的费用足以可以装备出四五十万步兵集团军，尤其是在弓弩兵极度发达的宋朝，四五十万个弓弩兵足以将十万骑
成马蜂窝，但为什么还要发展骑兵呢？对抗游牧民族为何必须以骑抗骑？在冷兵器时代，骑兵对于步兵具有天然的优势。这种优势主要表现在机动
和冲击力方面。也就是说，步兵打骑兵是赢了追不上，输了跑不掉。而骑兵在攻击步兵地时候，可以利用人和马的总动量来对其正面地步兵方阵形成更大的冲击力。马地质量比人要大的多，而运动速度又超过人地奔跑速度，因此骑兵所能够给与步兵的冲击力一般都是远大于步兵的冲击力。还有更为重要的是，机动可以在一定程度上扭转军队之间的数量对比，机动好的一方可以集中优势兵力攻击对方的某一个区域，局部形成了兵力优势。可能是防守的一方兵力更多，但是防守一方需要防守很多地方，在一个局部而言，进攻方可以形成数量优势，并且赶在防守方的援兵到达之前，将当地守军消灭掉。这也就是机动的作用，机动好的军队可以通过快速的转移自己的部队，总是能够形成局部战场的兵力优势，从而把缺乏机动的一方逐步歼灭。因此，游牧民族对于农耕民族来说，总是具有先天的军事优势。那么农耕民族该如何来应对，一种方法是利用地形，也就是利用山地来阻挡骑兵的奔跑，并且居高临下的攻击。长城正是这样防御方式。
另一个办法就是以骑兵对骑兵，通过组建强大的骑兵军团来对抗游牧民族。汉之对于匈奴，唐之对于突厥，都是沿用的这种策略。宋朝没有占据长城，也没有夺得养马良地，无法像汉唐时期大规模饲养战马装备骑兵，所以两个方法对他来说都是不成。赵宋被游牧民族的铁骑利用机动
和冲击的优势按着头打的历史也是卢俊义刻意发展马政的痛彻教训。
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